La vie d'un riche célibataire est bouleversée lorsque son frère divorcé et son neveu de dix ans débarquent dans sa propriété de Malibu. Malgré leurs différences, les deux frères décident de cohabiter pour offrir un foyer au jeune Jake.
Alan monte sur le toit pour remettre en place l'antenne parabolique mais tombe de l'échelle et se casse des cervicales et les poignets. Cela oblige Charlie à s'occuper de Jake, ce qui va mettre ses nerfs à rude épreuve.
Alan doit aller dans le bureau de la directrice de l'école de Jake, car celui-ci s'est moqué d'une fille de sa classe qui a des gros seins. Charlie va alors devoir s'occuper du cabinet de chiropractie d'Alan et il va engager une masseuse un peu trop proche des clients...
Charlie découvre qu'Alan recommence à voir Judith. Celui-ci lui demande de ne pas en parler à Jake afin qu'il ne soit pas déçu si la nouvelle relation tourne court.
Ils tentent alors de passer la soirée ensemble dans le jacuzzi de Judith, mais Jake ne cesse d'intervenir et Alan doit se contenter de rester caché.
Berta emménage chez Charlie lorsque chez elle la situation devient compliquée, ce qui a pour cause de faire déménager Alan et Jake dans un nouvel appartement bien moins confortable.
Jake demande conseil à Charlie au sujet d'une fille qu'il aime bien. Mais Alan lui interdit ce genre de discussion avec son fils après l'avoir traité de misogyne. Lorsque Rose explique à Charlie qu'il ne pourra s'engager dans une relation émotionnelle tant que ses problèmes avec sa mère ne seront pas résolus, il décide de l'affronter.
Après la fête d'anniversaire de Rose, celle-ci se réveille en compagnie de Charlie. Son père décide donc de débarquer afin de connaître les intentions futures de Charlie envers elle. Lorsqu'Evelyn arrive à son tour, le père de Rose tombe sous son charme. Mais leur relation devient très vite envahissante.
Charlie tombe sous le charme d'une professeur de danse, Mia. Mais celle-ci rejette catégoriquement ses avances. Il met alors tout en œuvre afin de prouver à Alan qu'il peut la séduire. Son plan : inscrire Jake aux cours de danse classique de Mia pour se rapprocher d'elle. Cette tentative devient compliquée lorsque Jake tombe lui aussi sous le charme de son professeur.
Alan fait la connaissance de leur riche voisine, Norma, déjà d'un âge avancé. Ils deviennent très vite amis, mais Alan prend peur lorsqu'il se rend compte qu'elle tente d'acheter son affection.
Charlie, lui, passe du bon temps avec sa nouvelle conquête pendant que Jake se tourne vers la religion
Alan fête la publication d'un article paru à son sujet avec Charlie, Jake et Evelyn. Mais sa mère n'étant pas vraiment impressionnée, il se console avec quelques verres. Au-dessus de la cuvette des toilettes, il annonce à Charlie qu'un nouvel Alan est né : un qui ne cherchera plus jamais l'approbation des femmes de sa vie, y compris sa mère.
Alan tombe amoureux de son professeur de cuisine, Sandy, qui s'avère être un modèle de perfection. Celle-ci emménage très vite chez Charlie et bouleverse la vie de ses habitants, comblés par ses petits soins. Ils comprennent alors que la perfection de Sandy peut virer à l'obsession.
Charlie prend rendez-vous chez la thérapeute de Jake afin d'apprendre à gérer l'hypersensibilité de son frère. En effet, Alan est déboussolé par le fait que son fils préfère passer le weekend chez ses amis plutôt qu'avec lui, et ne cesse de piquer des crises d'angoisse.
Charlie sort maintenant depuis plus d'un mois avec Mia et confesse qu'ils n'ont pas encore consommé leur relation. Frustré, il fait une proposition à celle-ci, qu'elle rejette avec violence. Après s'être excusé, il avoue alors à Mia qu'il est prêt à attendre que leur relation s'épanouisse.
Mia est enfin prête à passer à l'action avec Charlie, mais découvre que celui-ci n'a pas encore dit à ses ex conquêtes qu'il était engagé dans une relation sérieuse.
Alan, lui, commence à sortir avec Kandi, l'ex de Charlie, deux fois plus jeune que lui.
Charlie n'arrive pas à se faire à sa nouvelle vie saine imposée par Mia. Il se met alors à cacher ses cigares et ses bières dans son garage. Lorsque celle-ci découvre sa cachette, il commence à se poser des questions quant à ses vrais sentiments.
Alan hésite à présenter Kandi à sa famille, et notamment à Evelyn, pendant la fête d'anniversaire de Jake.
Rose, elle, transforme son nouveau petit ami en une réplique exacte de Charlie.
Charlie met en garde Alan lorsque celui-ci dépense tout son argent pour faire plaisir à Kandi. N'écoutant pas ses conseils et n'ayant plus d'argent pour la pension alimentaire de Judith, Charlie se voit obligé de couvrir les arrières de son frère.
Charlie est complètement chamboulé par son manque de relations charnelles. Il ne s'aperçoit même pas que Kandi vit depuis quelques semaines chez lui.
Après s'être disputée avec Alan, Kandi passe la soirée avec Judith, et décide d'emménager avec elle. Sa mère fait alors irruption, et Charlie entrevoit une lueur d'espoir.
Alors que Judith vit maintenant avec Kandi et ne cesse de la monter contre Alan, Mandi, la mère de Kandi, lui conseille d'aller chez son ex-femme afin de reconquérir sa fille.
De son côté, Kandi présente son père, Andy, à Judith.
Le professeur de Jake, Francine, convoque Alan et Judith pour leur parler du comportement de leur fils en classe. Alan, désespéré du manque d'intelligence de Kandi, se prend alors d'affection pour Francine.
Pendant ce temps, Charlie est forcé d'aider Jake à répéter son audition pour la comédie musicale donnée par son école.
Jake est invité à sa première boum donnée par une fille. Charlie lui donne alors des conseils sur les relations avec les femmes. Alan, d'abord énervé par le fait que Charlie lui ait volé un moment père/fils important, se rend compte qu'il est également jaloux que son grand frère ne lui ait jamais donné ce genre de conseils par le passé.
Mia est de retour en ville et demande à Charlie de passer la voir. D'abord contre, et essayant de convaincre tout le monde qu'il ne ressent plus rien pour elle, il finit par céder. Là-bas, Mia lui demande un service: son sperme pour un bébé. Se rendant compte qu'il ne peut y arriver, Charlie lui fait alors une proposition.
Les préparatifs du mariage se passent bien jusqu'au moment où les familles de Charlie et Mia se rencontrent. Ils décident finalement d'aller se marier à Las Vegas en petit comité.
Mais arrivés devant l'autel, Mia fait comprendre à Charlie qu'Alan et Jake devront partir après le mariage..