Les aventures vécues au XXIIIe siècle, par James T. Kirk, capitaine du vaisseau Entreprise NCC-1701 et son équipage. Leur mission quinquennale est d'explorer la galaxie afin d'y découvrir d'autres formes de vie et d'enrichir ainsi les connaissances humaines.
L'USS Enterprise, en route pour une mission d'exploration, intercepte un signal de détresse d'un vaisseau disparu deux cent ans auparavant. Un phénomène inconnu touche un des membres d'équipage, provoquant chez lui, des pouvoirs divins.