Sept ans après que le monde soit devenu une vaste étendue glacée, les survivants ont trouvé refuge dans un train en perpétuel mouvement. Composé de 1001 wagons, l'engin fait le tour du globe à toute vitesse. A bord, la guerre des classes, l’injustice sociale et la politique interne sèment le trouble.
Layton learns who was responsible for the experiments on Josie and Liana, before also finding out who froze the world; Big Alice approaches New Eden but can't cross the booby-trapped bridge.